SynopsisL’histoire de ce forum se situe après le premier opus. Après avoir aidé les X-Men à récupérer Malicia, Wolverine partit à la recherche de son passé, guidé par le Professeur Xavier. Mais une menace pèse sur les mutants en la personne de William Stryker. Animé par une haine inexplicable, le Colonel, aidé par la terrible Lady Deathstryke, se lance dans une terrible chasse contre les mutants. Mais pourquoi et dans quel but ? C’est aux mutants de le découvrir…
L’Institut Xavier est toujours un refuge pour mutant. Mais aux yeux du monde, ce n’est qu’une école de surdoué. Les élèves apprennent à contrôler leurs pouvoirs avec les X-Men Coté X-Men, on retrouve des nouveaux venus tels que Dark Angel, Solar, Branwen Arden Hope, Jason Fly, Chris Folley ou encore Nathalian Nash entre autres… Coté élèves, l’Institut en voit arriver tous les jours, de partout, les accueillants à bras ouverts. Souvent désorientés, effrayés, et rejetés, ces enfants voient en l’Institut Xavier un abri à l’égard des simples humains. A la fin de leur cursus scolaire et de la maîtrise de leur pouvoir, ils choisissent leurs voies : soit ils réintègrent la société en tant que jeunes gens instruits, soit ils restent à l’Institut, devenant X-Men ou simple professeur.
La Confrérie, elle aussi, n’a pas perdu de son influence. Menée d’un bras de fer par Magnéto, elle compte de plus en plus d’adepte de jour en jour, ce qui très inquiétant…
Les idées de Magnéto, base même de la Confrérie, sont radicalement opposées à celui du Professeur X. Tandis que les X-Men prône pour la bonne entente entre les mutants et les homo sapiens, les Confréristes n’ont pour but que d’affirmer leur prééminence en réduisant l’humanité en esclavage.
Deux clans que tout oppose. Mais cependant, face à Stryker et Lady Deathstryke, Magnéto va s’associer à son vieil ami. Mais gageons que celui-ci a une autre idée derrière la tête…
Dans cette guerre vient aussi s'ajouter un nouveau facteur, le gouvernement Américain, soucieux de garder le calme parmi ses concitoyens a choisi de nommer le plus célèbre des détectives au monde, un homme qui a toujours su rester anonyme malgré son nombre phénoménal d'enquêtes, il n'est connu que sous le nom de Treshold, et son seul but est de faire régner le calme et la justice en utilisant tous les moyens légaux possibles…
L'apparition de Threshold amène aussi le venue d'un autre personnage bien moins scrupuleux, un homme aussi anonyme que son pire ennemi, mais qui se fait nommer Kira, son but est de punir tous les criminels en utilisant ses pouvoirs pour faire régner un monde parfait, d'ordre et de paix...
Bienvenue chez les mutants, ami ou ennemi...